Chorzy kwalifikowani do przeszczepu serca muszą spełniać ściśle określone wskazania oraz nie posiadać przeciwskazań. Wskazaniami do przeszczepu serca są: schyłkowa niewydolność serca o złym rokowaniu, której towarzyszą ciężkie objawy; pacjent współpracujący, stabilny emocjonalnie, który przestrzega zaleceń lekarskich.

Przeciwskazaniami są:

• aktywne zakażenie,
• nadciśnienie płucne oporne na leczenie,
• ciężka choroba naczyń w tym mózgowych,
• choroba nowotworowa,
• ciężka niewydolność nerek,
• inna ciężka choroba związana ze złym rokowaniem,
• otyłość z BMI >35 kg/m² 
• uzależnienie od alkoholu lub substancji aktywnych.

Od przeszczepu serca dyskwalifikuje się także pacjentów, których sytuacja społeczna nie pozwala na uzyskanie odpowiedniego poziomu współpracy w leczeniu w warunkach ambulatoryjnych.